Морфологический центр является лечебно-профилактическим органом Министерства здравоохранения и медицинской промышленности Туркменистана. В его составе действуют центральный судебно-медицинский и патологоанатомические учреждения, а также Учебно-исследовательское отделение Туркменского государственного медицинского университета.