Отделы:
Текстология. Научное описание и каталогизация. Народное творчество. Источники туркменской истории. Источники туркменского языка. Реставрация. Отдел обслуживания, инженерно–технических работников, помощников.
Основное направление научной деятельности:
Сбор, реставрация, изучение и издание восточных рукописей.
В институте работает малая типография. В ней печатаются научные труды, выполненные в институте. В институте работает фотолаборатория, где изготавливаются фотокопии самых ценных рукописей. Институт оснащён современным оборудованием, с помощью которого очищаются, и реставрируются поврежденные рукописи.